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8月29日,南京医科大学生殖医学与子代健康全国重点实验室郑科教授、郭雪江教授,基础医学院神经生物学系林明焰副教授和中南大学谭跃球教授等课题组合作,在学术期刊《科学》在线发表了题为《哺乳动物精子发生RNA结合蛋白质的全景图谱》的学术论文。
哺乳动物睾丸转录大多数基因组,是含有最为复杂转录组的组织器官之一。然而,大家对于RNA结合蛋白(RBP)怎么样动态调节精子发生过程中的很多RNA缺少系统性知道。尤其是,RNA结合蛋白的非结构域元件(不在已注解结构域中的短基序)正在引起大家的兴趣和关注。到现在为止,这类元件还未在动物模型中得到充分探索。尽管已报道RNA结合蛋白的功能障碍可能导致各种疾病的发生,但对其序列突变与特定疾病之间的关联缺少全基因组水平的认识,其中包含男士不育(一种全球性的主要生殖问题)。
为了系统地鉴别不同阶段小鼠雄性生殖细胞中的RNA结合蛋白,团队离别了精原细胞、粗线期精母细胞和圆形精子细胞,并进行了RNA相互用途组捕获。研究打造了较完整的精子发生RNA结合蛋白图谱,并发现那些具备以前未知的RNA有关活性、特异于减数分裂和精子变形阶段发挥功能的RNA结合蛋白。论文进一步展示了RNA结合蛋白在精子发生过程中的多层次动态性,涵盖了蛋白质组表达模式、蛋白质组-转录组同步/非同步性、相对RNA结合活性和核糖核蛋白协同行为。
下一步,团队用RBDmap办法进一步捕获睾丸RNA交联肽,用以筛选RNA结合结构域和非结构域元件,进而用多种办法对其常见性、特质、功能等进行生物信息剖析和实验研究。研究发现了一种多两性非结构域元件,称为谷氨酸-精氨酸(ER)基序,是一种广泛存在的富含E和R的短片段,它与RNA结合蛋白中的卷曲螺旋地区在地方上偶联,具备邻近残基对的进化共变异特点,显著增强了其宿主蛋白结合RNA的能力。研究聚焦RNA结合蛋白NONO(含非POU结构域的八聚体结合蛋白)中的ER基序,借助动物模型并在单细胞转录组水平上证明其调节生精细胞从有丝分裂期到减数分裂期的转变。
团队还整理了非梗阻性无精子症或少精子症病人的男士不育队列的全外显子组测序图谱,以此在系统层面上揭示RNA结合蛋白对男士不育的突出用途及ER基序等非结构域元件的潜在临床致病性。
该研究为与精子发生和男士不育有关的RNA结合蛋白提供了全方位和丰富的资源,并证明了非结构域元件在调控RNA和精子发生中的功能意义,凸显了该资源在解码男士生育的遗传和分子基础方面的潜在宽广而要紧的价值。
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